Для NetBSD разработана реализация FUSE совместимой поддержки файловых систем работающих на уровне пользователя. Главное отличие новой системы - полностью переработанный код (PUFFS), распространяемый в рамках BSD лицензии.

В настоящее время с PUFFS работают модули: fuse-archivemount, fuse-cddfs, fuse-cryptofs, fuse-curlftpfs, fuse-httpfs, fuse-lzofs, fuse-ntfs-3g и fuse-unionfs.