Если используется русский apache и после закачки через форму файл приходит битый:
   CharsetRecodeMultipartForms Off

Если пользователь скачивает битый файл (например, rar-архив):
    - Убедитесь, что для типа вашего файла присутствует корректная запись вmime.types;
   - Проверьте, какой тип по умолчанию установлен в httpd.conf, лучше поставить
        DefaultType application/octet-stream

Если PHP скрипт выдает битую информацию:
     См. заметку "В чем может быть причина битых бинарных файлов на выходе PHP"
     http://www.opennet.dev/tips/info/740.shtml