> Видишь вот программу. А откуда она? Из крона? Или анакрона?

Опять двадцать пять.  anacron дополняет, а не заменяет cron.  Соответственно мест не прибавляется.

> А может в иниттабе? А может, в стартовых скриптах? Или rc.local? А может, из
> inetd? А может быть ворона? А может страус злой?!

Вы мне сейчас напомнили огрепливанье /etc/systmd /lib/systemd с последующим выяснением, кто на ком стоял.

> В результате какая-то совсем тривиальная задача ("вырубить это нафиг" например)
> становится целым квестом по полудюжине закоулков.

Да-да-да.  Особенно когда вырубание неэффективно из-за того, что ещё что-то взяло и запустило.

> 2) Мне не нравится что оно своими чисто техническими *костылями* гадит в
> конфигурацию cron, разбавляя ее спамом, который мне бесполезен и как таковой
> не подлежит редактированию админом. А чего ради эти ошметки должны мои
> глаза мозолить?

Мозоли предъявите.

> 3) В силу реализации оно довольно слоупочное и особой гибкостью не отличается.
> Пародия на настоящий event-driven

Возвращались бы уже на винду свою за "настоящим ивент-дриваном", в самом деле...