> Добрый день! Можно ли включить samba в несколько workgroup - есть ли
> у кого реальный опыт?

Думаю что нет, без спец. телодвижений с запуском разных демонов(каждый со своим конфигом)
попробуйте винду (клиент или сервер) включить в несколько групп, это просто не заложено в функционал.

хотя нет, с конфигом тоже не прокатит, порт 139 на всех не поделишь