Я имею ввиду обратную ситуацию. Обратное направление ссылок: изнутри копируемого дерева внаружу его.

mkdir tmp
pushd .
cd tmp
ln -s ../hello/world .
popd
mkdir container
cp -a tmp container/
ls -l container/tmp
total 0
lrwxrwxrwx 1 user group 8 Jul 21 15:58 world -> ../hello/world

Хотя чтобы всё работало должно быть:
ls -l container/tmp
total 0
lrwxrwxrwx 1 user group 8 Jul 21 15:58 world -> ../../hello/world