Обсуждение статьи тематического каталога: Пример решения для сбора статистики через iptables (traffic perl iptables statistic linux)Ссылка на текст статьи: http://www.opennet.dev/base/net/iptables_stat2.txt.html
Вообщето в iptables есть замечательное действие
ULOG
имхо прел подойдет для более пристойной работы ((:
а для пихания в бд есть ulogd.